Недостатки С++ — это в первую очередь тяжелое наследие Си: ужасная система инклудов и полное отсутствие модульности. Включение заголовочного файла приводит по сути к включению всего содержимого файла в единицу компиляции; поскольку заголовочные файлы включают друг друга, а современные библиотеки могут содержать десятки тысяч заголовочных файлов… разумеется, это не может не сказываться на времени компиляции. Иногда помогают различные решения-хаки типа «precompiled headers» (pch), но, как показывает практика, эти решения тоже далеко не идеальны. Например, Visual C++ не позволяет создавать общие pch для нескольких проектов одного solution (при том, что в precompiled headers как правило включают действительно общие и неизменяемые заголовки — такие как stl, boost и т. п.).

http://habrahabr.ru/post/257875/