Если при сохранении базы паролей Keepass в Ubuntu выдает вот такую ошибку:

То дело не в правах или настройках Keepass, проблема в Mono и баге со сжатием GZip.
Поэтому идём в настройки базы данных и убираем сжатие:

Теперь всё будет сохраняться.
Отсюда